Zaštita podataka iznimno nam je važna. Podaci/odgovori prikupljeni u okviru vaše ankete pohranjuju se u zasebnu bazu podataka sa zasebnim korisničkim imenom i lozinkom za svaku instancu unutar LimeSurvey Clouda. Veza koja se uspostavlja između vašeg preglednika i naših poslužitelja također je šifrirana pomoću protokola SSL.
Podaci u sustavu LimeSurvey prema standardnim se postavkama ne šifriraju jer im redovito pristupa aplikacija LimeSurvey (nisu u mirovanju). U postavkama, međutim, možete odrediti da odgovori na određenu vrstu pitanja budu uvijek šifrirani u mirovanju. Osim toga, kod podataka o ispitanicima možete odrediti da se određena polja uvijek šifriraju.
Svakoga dana također izrađujemo sigurnosne kopije vaših podataka u sustavu LimeSurvey.Ti su podaci u mirovanju i šifrirani su te su sigurno pohranjeni na drugom disku, ali na istoj lokaciji na kojoj se nalazi poslužitelj na kojem se pohranjuju vaši podaci.