Hemos actualizado de la versión  3.17 a la  Versión 3.25.17. En el entorno de desarrollo ha funcionado bien pero en el entorno de producción los cambios que teníamos en una plantilla extendida se han perdido. Intentamos volver a poner los cambios en el fichero /upload/themes/survey/extends_extiende_fruity/css/custom.css y el cambio queda reflejado pero no se ve en la encuesta. No podemos hacer cambio sobre las plantillas extendidas.

Durante el proceso de update tienes que tomar cuidado al dejar las pastas "upload" igual (o copiar el contenido de una copia que haces antes del update).

Ahora, puede ser que por causa del facto que tu téma no existia, Limesurvey ha aplicado un téma standard.

Que passa si cambias el téma para un standard y despues vuelves a tu téma extendido?

No podemos hacer cambio sobre las plantillas extendidas.

Que significa esto?

Hemos extendido la plantilla fruit y creado extends_extiende_fruity, queremos aumentar la altura de la cabecera en el fichero /var/www/html/limesurvey/upload/themes/survey/extends_extiende_fruity/css/custom.css
hacemos la modificación, guardamos los cambios en local, aplicamos la plantilla a una encuesta pero no se modifica la altura de la cabecera.
Hemos realizado lo que pone en el manual

• Puede activar el modo de depuración: se desactivará el administrador de activos, por lo que se invocan los archivos css/js reales de sus temas (pero luego, debe actualizar la memoria caché del navegador en cada carga)
• Puede actualizar el caché de activos: desde Configuración global -> General -> Borrar caché de activos.

Pero no nos funciona

Bueno, entonces no sé que está pasando.

Tienes un screenshot como parece y como debería parecer? Y también un link a una encuesta de test para dar un vistazo?

Lo has intentado con otro navegador? O limpiar el Cache del navegador?

Si hemos limpiado la cache y cambiado el navegador y no funcionaba.
Intento resumir nuestro problema al exportar plantillas personalizadas de un entorno de preproducción a uno de producción:

1.- Si nos funciona en el entorno de preproducción: Heredando una plantilla y editándola personalizando el custom.css

2.- Exportando esa plantilla e importándola en producción deja de funcionar la personalización en el custom.css

Sin embargo si hacemos todo el proceso en producción de nuevo, es decir, heredamos, cambiamos el custom.css si funciona.

Es decir, tenemos que repetir los cambios en cada entorno para poder modificar el aspecto de nuestras encuestas.
Muchas gracias por su atención